En 2011 hizo un episodio piloto para un programa propio al estilo de La hora de José Mota, llamado Esta noche... Juan Muñoz. La serie pretendía ser una sucesión de sketches con los mismos actores que colaboran en La hora de José Mota, como Enrique Villén o Manuel Tallafé. Sin embargo, la serie no pasó de dicho piloto y este nunca llegó a emitirse.

Ejerció como colaborador en José Mota presenta..., haciendo papeles varios pero el más característico es el de Juan de Dios de su anterior paso por Cruz y Raya.

De 2016 a 2017 formó parte del grupo de concursantes de la quinta edición de Tu cara me suena, donde quedó el 7° clasificado con 235 puntos.

En la actualidad, Muñoz desarrolla, además, monólogos humorísticos y comedia stand-up en distintos recintos y teatros de España, retomando, así, sus orígenes en el humor.